上海药物代谢研究中心为独立事业法人单位，业务主管单位为上海市科学技术委员会，技术依托单位为中国科学院上海药物研究所。中心的业务范围包括药物吸收、分布、代谢、排泄及毒代动力学研究；生物样品中微量药物及代谢产物分析；候选化合物药物代谢筛选；药物制剂的生物利用度和生物等效性评价；药物代谢相关的化合物制备、新方法开发；技术服务、技术开发、技术转让、技术咨询及学术交流与专业培训。
中心拥有先进的仪器设备，其中液相色谱-质谱-质谱联用仪7台，高效液相色谱仪8台。